果皮破损
百香果中含有大量的水分，还含有多种糖类物质，若百香果的表皮破损，容易滋生细菌，受细菌及微生物的污染，在适宜的温度下，细菌及微生物会大量繁殖，从而导致百香果霉变。
保存不当
百香果中含有大量的糖类及水分，适宜保存在阴凉、干燥的地方，若将百香果贮存在潮湿的环境中，可能会滋生大量的细菌，果肉中酶类物质就会发酵，保存时间较长的情况，容易产生霉变现象。